Membuat model DNA

Membuat model DNA

Pendahuluan

DNA adalah molekul kompleks yang terdapat pada semua organisme. Untuk memahami tentang struktur, fungsi dan replikasinya dapat dilakukan dengan cara pembuatan model DNA. DNA mengandung informasi genetic yang dapat diwariskan pada keturunan berikutnya. Berbentuk double heliks dengan struktur berbentuk benang panjang yang tersusun atas gula dan pospat serta basa nitrogen (adenine, timin, guanine dan sitosin). Satu unit dasar yang menyusun molekul DNA disebut Nukleotida. Sebuah nukleotida tersusun atas pospat, gula deoksi ribose dan basa nitrogen (A, T, S, atau G). Kode-kode yang terdapat pada DNA digunakan untuk membuat protein dari asam amino di dalam sitoplasma. Proses pembentukan protein diawali dengan pembentukkan RNAd yang membuat salinan DNA di dalam inti, selanjutnya protein dibangun di ribosom.

Kegiatan bertujuan untuk mengenalkan bagaimana struktur DNA dan menentukan jenis asam amino yang dibentuk berdasarkan kode-kode dari basa nitrogen.

Tujuan:

1. Siswa dapat mempelajari struktur empat jenis nukleotida yang membentuk DNA

2. Siswa dapat membuat bagian-bagian dari model DNA

3. Siswa dapat menentukan jenis asam amino yang terbentuk dari urutan jenis basa nitrogen dari model DNA yang dibuat.

Alat dan bahan

1. Unit-unit dasar DNA seperti gambar dibawah ini

1. Pewarna (merah, hijau, kuning, biru, hitam dan ungu)

2. Gunting

3. Lem

4. Pensil

5. Kawat

6. Tali /senar

Prosedur A à membangun DNA

1. Potong unit-unit pola di atas, lihat table 1 untuk jumlah yang dibutuhkan

2. Berilah warna untuk basa nitrogen, pospat dan gula; adenine (biru), guanine (hijau), timin (kuning), sitosin (merah), pospat (hitam) dan deoksi ribose (ungu).

3. Bentuk struktur nukleotida dengan menempelkan pospat, gula dan satu basa nitrogen menjadi satu rangkaian (lihat diagram 1)

1. Buat 23 buah nukleotida lainnya sehingga seluruh nukleotida terbentuk 24 buah nukleotida.

Aturan untuk pasangan basa DNA

A berpasangan dengan T

S berpasangan dengan G

2. Gunakan 12 nukleotida untuk membuat benang sebelah kiri dan 12 nukleotida lainnya untuk benang sebelah kanan

3. Pasangkan benang sebelah kiri dengan benang sebelah kanan sesuai dengan urutan pasangan basa nitrogennya

4. Terbentuk DNA yang berbentuk seperti tangga, gunakan tali /senang untuk menghubungkan masing-masing basa nitrogen, gunakan kawat agar DNA tersebut dapat digantung.

Prosedur B à menentukan asam amino

1. Ambil untaian benang sebelah kiri DNA, dan buat pasangan basa nitrogen untuk RNAd

2. Gunakan urutan 3 basa nitrogen dari RNAd menjadi 1 kode asam amino yang dikenal dengan istilah kodon

3. 1 untaian benang RNAd akan menghasilkan 4 kode asam amino, cocokan kode tersebut pada table 3 dibawah.

Tabel 3 - kodon RNAd

Asam Amino	Kodon	Asam amino	Kodon
Alanin	GCU, GCC, GCA, GCG	Leusin	UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG
Arginin	CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG	Lisin	AAA, AAG
Asparagin	AAU, AAC	Metionin	AUG
Asam aspartat	GAU, GAC	Fenilalanin	UUU, UUC
Sistein	UGU, UGC	Prolin	CCU, CCC, CCA, CCG
Glutamin	CAA, CAG	Serin	UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,AGC
Asam glutamat	GAA, GAG	Treonin	ACU, ACC, ACA, ACG
Glycine	GGU, GGC, GGA, GGG	Trpytophan	UGG
Histidin	CAU, CAC	Tirosin	UAU, UAC UAU, UAC
Isoleusin	AUU, AUC, AUA	Valin	GUU, GUC,
Start	AUG, GUG	Stop	UAG, UGA, UAA

Tabel 4

Basa DNA, kodon RNAd, dan asam amino

DNA

RNAd

Asam amino

Kesimpulan:

1. Sebutkan 4 jenis asam amino yang terbentuk dari satu untaian DNA tersebut.

2. sebukan 2 molekul yang membangun bagian sisi dari DNA.

3. Apakah bentuk model DNA yang kamu buat seperti tangga?

4. Apa jenis basa nitrogen yang ada pada DNA tapi tidak terdapat pada RNA?

5. Apakah kodon start digunakan untuk membuat protein?

6. Apakah kodon stop digunakan untuk membuat protein

7. Dalam sebuah sel, dimanakah ditemukannya DNA, RNA dan asam amino?

8. Jika kadar adenine dalam DNA ada 25 % berapakah kadar sitosin?

9. Apa yang akan terjadi jika RNA membuat kesalahan ketika menyalin kode-kode dari DNA?